游戏加入了大蛇、爆风、96BOSS队的基斯、克劳撒、比克，如月影二等人物
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拳皇98AE完美修复版是一款针对拳皇98原版所进行的版本修改，该游戏的基本玩法还是跟原版的保持，但是在人物操作上进行改进，游戏加入了大蛇、爆风、96BOSS队的基斯、克劳撒、比克，如月影二等人物，使其角色更加丰富。
此版本中有大蛇，爆风，96BOSS队的基斯、克劳撒、比克，如月影二等人物
kof98ae大蛇选择方法：在爆风头像上按开始键即可进行游戏!
新增加了如月影二，96boss队(克劳萨;吉斯-霍华德;Mr-big)暴走的丽安娜，暴走的八神，大蛇，以及96的boss高尼兹!再加上可选人物，招式(其中包含99.2000.2001.2002的必杀和隐藏)以及血槽的大量增加，使游戏的可玩度大大提高!
bug：选推拳宗游戏会花屏!
大蛇蹲着被人击中时会花屏，以及有时放大蛇之火的时候会黑屏!
八神放隐藏的时候有一定几率花屏!
暴风高尼兹放大招时，人物会变成npc操作!
招式：每个人都有隐藏，但都是只有一半血的时候，爆气+一管气才可以发!具体自己研究!
隐藏人物
在选人画面中按开始键选择以下人物可出现对应的隐藏人物
京（'95京）、特瑞（里特瑞）、安迪（里安迪）、丈（里丈）、RYO（里RYO）、罗伯特（里罗伯特）、百合（里百合）、舞（里舞）、比利（里比利）、大蛇队（里大蛇队）
隐藏生存模式
98相信大家都知道生存模式吧，可是你们是否知道还有个隐藏的生存模式？
其实只要把普通生存模式通关就知道了，会出现隐藏生存模式的秘技，然后重新进入模式选择菜单，光标移到survivor上，按住START键不放再C和A一起按就会出现（不过推荐先一起按住START+C键不放，再按A键，就能保证100%召唤出隐藏生存模式）
隐藏的生存模式对手的组队完全是随机的，不计时，一旦失败是无法像普通生存模式一样可以接关的。
崔稻妻特别画面
（要求非常高）达成以下条件（更需要运气）就会出现
1.队伍中必须有崔稻妻
2.场景必须是“日本街头”（Japan Street）
3.第三回合崔稻妻30秒内KO对手，但不能是perfect，且KO对手必须用的是必杀技、超必杀技甚至MAX超必杀技
4.KO对手后按住C键不放选择胜利动作
以上条件都达成，就会出现SNK日本电台两位人气主持骑单车的场景
矢吹真吾的乱入
以下条件达成一个，矢吹真吾就会乱入
1.STAGE-3 CLEAR后分数≥10W
2.STAGE-4期间至少打出一个perfect，分数≥10W
3.STAGE-5要STREAK CLEAR（1挑3取胜），分数≥10W
