游戏内的招式也新增了各种超必杀与隐藏动作
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拳皇98ae2016修正版是一款基于官方原版所进行的修改优化版本。在这个版本中，新加了许多原本不会在这个版本中出现的角色，让玩家有很多的角色选择，而且游戏中还添加了各式各样的超级必杀技和隐藏动作，赶紧试试吧！
本作以拳皇98AE为蓝本进行修改，游戏内玩家可以选择大蛇作为主战角色，新增了暴走莉安娜与暴走八神，游戏内的招式也新增了各种超必杀与隐藏动作，使游戏可玩性大大提高。
版本中有大蛇（问号右边按住开始键选择，阳光出招为236236A），爆风，96BOSS队的基斯、克劳撒、比克，如月影二等人物。新增加了暴走的丽安娜，暴走的八神，以及96的boss高尼兹！再加上可选人物，招式（其中包含99.2000.2001.2002的必杀和隐藏）以及血槽的大量增加，使游戏的可玩度大大提高！
每个角色每局都可以单独从新选择模式：
ADV模式：
1、A，B，C，D攻击中敌人时，可以按AB费气向前闪。
2、按BC爆气，消耗一个POW。POW槽不自减，自身攻击中敌人（不包括防御）时能取消出其它招式，超杀，取消时消耗一定的POW槽；并且，第一次取消时，扣接下去的连技的攻击力的1/3，第二次取消时，在扣1/3的基础上再扣接下去的连技的攻击力的1/2。第三次。同样是1/2。
3、前AB，后AB为前后滚。
EX模式：
1、按BC爆气，拥有KOF2K的BCD功能。消耗一个POW。发超杀时会自动解除爆气状态。
2、AB为原地闪避。
3、某些招式按BC消耗一个POW，会有弹墙功能（标注；DC）的招式。
SP模式：
1、按BC爆气，消耗一个POW；爆气状态时攻击力增加，发动超杀时，爆气状态不会取消；爆气状态不能发MAX，MAX2；
2、有SC功能。
